مستحضرات الإنزيممشتقة من الكائنات الحية وهي أكثر أمانًا بشكل عام ويمكن استخدامها بكميات مناسبة وفقًا لاحتياجات الإنتاج. هناك ثلاث مجموعات رئيسية من الكائنات الحية الدقيقة التي تنتجالاستعدادات الانزيمية: الفطريات الخيطية ، والخمائر ، والبكتيريا ، وتستخدم بشكل أساسي بكتيريا الهواء الجيدة ، والسلالات واستخدام العديد من الإنزيمات الصناعية الرئيسية على النحو التالي:
(1) الأميليز
يحلل الأميليز النشا لإنتاج مالتو قليل السكاريد الفطرية والمالتوز ، ويتم إنتاجه بشكل أساسي عن طريق التخمير المغمور لعصيات Bacillus subtilis و Bacillus licheniformis من جنس Bacillus ، وهذا الأخير ينتج إنزيمات قابلة للحرارة ، بالإضافة إلى أنه يتم إنتاجه أيضًا عن طريق المغمورة وشبه الصلبة التخمير مع سلالات الرشاشيات و Rhizopus ، وهو مناسب لتجهيز الأغذية. يستخدم الأميليز بشكل أساسي لصنع السكر ، وإزالة المنسوجات ، ومعالجة المواد الخام للتخمير ومعالجة الأغذية ، ويمكن لـ Glucoamylase تحلل النشا إلى جلوكوز ، والذي يتم إنتاجه تقريبًا بواسطة Aspergillus niger التخمير المغمور لإنتاج السكر وإنتاج الكحول ومعالجة المواد الخام للتخمير ، إلخ.
(2) البروتياز
أكثر السلالات وأصناف الإنتاج استخدامًا: استخدام Bacillus licheniformis و Bacillus pumilus و Bacillus subtilis لإنتاج الأنزيم البروتيني البكتيري عن طريق التخمير المغمور ؛ استخدام التخمير المغمور Streptomyces و Aspergillus لإنتاج البروتياز المحايد وبروتياز حمض الرشاشيات لإزالة الجلد وتليين الفراء والصيدلة وصناعة الأغذية ؛ تخضع بعض البكتيريا من جنس Mucor للتخمير شبه الصلب لإنتاج المنفحة ، والتي تحل محل المنفحة المستخرجة أصلاً من العجل المعدة في صناعة الجبن.
(3) ايزوميراز الجلوكوز
مجموعة متنوعة تطورت بسرعة في السبعينيات ، أولاً ، يتم استخدام التخمير المغمور للحصول على خلايا العقدية. بعد التثبيت ، يتم تحويل محلول الجلوكوز إلى شراب يحتوي على حوالي 50٪ من الفركتوز. يمكن استخدام هذا الشراب في الصناعات الغذائية بدلاً من السكروز ، وقد أصبح استخدام الأميلاز والجلوكوز أميلاز وإيزوميراز الجلوكوز لإنتاج شراب الفركتوز من نشاء الذرة أحد صناعات السكر الناشئة.